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Afrah Mehdi Alwan, Hanaa Naji Abdullah
, Alaa Salim Hamzah
Antecedentes: La Klebsiella pneumoniae multirresistente causa infecciones invasivas con altas tasas de morbilidad y mortalidad.
Los integrones de resistencia son elementos hereditarios críticos que actúan como dianas para la terapéutica de las resistencias a fármacos antimicrobianos (RAM) mediante silenciamiento génico o terapias combinadas.
Objetivos: El objetivo de este estudio fue analizar molecularmente los genes integrones en K. peumoniae MDR.
Métodos: Se recogieron un total de 250 muestras clínicas en algunos hospitales de Bagdad procedentes de diferentes fuentes clínicas. K. pneumoniae se identificó mediante pruebas morfológicas y bioquímicas y se confirmó mediante el sistema VITEK 2 compact. Se utilizó la prueba de susceptibilidad a los antibióticos, según CLSI, 2023. Se extrajo ADN de los aislados bacterianos MDR para las pruebas de genotipado. Los genes integrones (Int1, Int2 e Int3) se detectaron mediante PCR utilizando cebadores específicos. Los productos de la PCR se enviaron a Macrogen Corporation en Corea para su secuenciación. El análisis de las secuencias realizado mediante un generoso software y el dibujo de árboles filogenéticos entre aislados locales solos, así como entre aislados locales y globales, está documentado en NCBI. Los tres aislados locales seleccionados que mostraron variación genética y se documentaron en el NCBI fueron Kp Iraq 94 int1, Kp Iraq 95 int1 y Kp Iraq 96 int1.
Resultados: De los 68 aislados, 44 (64,70%) se clasificaron como MDR. Los resultados de la reacción PCR fueron positivos (100%) para Int1 y negativos (0,0%) para los genes Int2 e Int3. El análisis de secuenciación génica mostró variaciones genéticas entre los aislados bacterianos locales y globales.
Conclusiones: La presencia del integrón de clase 1 en K. pneumoniae MDR se asocia significativamente a la capacidad de K.
pneumoniae para adquirir resistencia a los antibióticos.
Background: Multidrug resistance Klebsiella pneumoniae causes invasive infections with high rates of morbidity and mortality.
Resistance integrons are critical inherited elements that act as targets for therapeutics to antimicrobial drug resistances (AMRs) using gene silencing or combinative therapies.
Objectives: This study aimed to molecularly analyze the integron genes in MDR K. peumoniae.
Methods: A total of 250 clinical samples were collected in a few hospitals in Baghdad from different clinical sources. K. pneumoniae was identified by morphological and biochemical tests and confirmed by the VITEK 2 system compact. Antibiotic susceptibility test used, according to CLSI, 2023. DNA from MDR bacterial isolates was extracted for genotyping tests. Integron genes (Int1, Int2, and Int3) were detected by PCR using specific primers. The PCR products were sent to Macrogen Corporation in Korea for sequencing.
The analysis of sequences carried out by generous software and drawing phylogenetic trees between local isolates alone as well as between local and global isolates is documented in NCBI. Selected three local isolates that showed genetic variation and documented in the NCBI were Kp Iraq 94 int1, Kp Iraq 95 int1, and Kp Iraq 96 int1.
Results: Out of 68 isolates, 44 (64.70%) were categorized as MDR. PCR reaction results were positive (100%) for Int1 and negative (0.0%) for both Int2 and Int3 genes. Gene sequencing analysis showed genetic variations between local and global bacterial isolates.
Conclusions: The presence of class 1 integron in MDR K. pneumoniae is significantly associated to K. pneumoniae's capacity to acquire antibiotic resistance.
