Objetivo: analizar los efectos secundarios del uso del implante anticonceptivo subdérmico de etnogestrel (IASE) en adolescentes chilenas. Personas, material y método: Estudio analítico de una cohorte de adolescentes usuarias de IASE entre los años 2007 y 2012. Resultados: Se indicó el IASE en 62 adolescentes. La edad promedio en el momento de la colocación del IASE fue de 16,2 años. El 88,7% de las adolescentes habían iniciado actividad sexual. El 83,9% refirió alguna patología: un 25,8% un problema médico de salud y un 58,1% una patología mental. El 15,5% eran obesas. El 65,3% no presentó efectos secundarios en los primeros 3 meses de uso del IASE. El efecto secundario más frecuente el primer año fue la cefalea (15,9%) y en el segundo año la mastalgia (15,9%). Durante el tercer año de uso el 73,4% no presentó efectos secundarios. El porcentaje de adolescentes obesas se elevó desde el 15,5 hasta el 22,6% desde el inicio del uso del IASE hasta el final, y el porcentaje de adolescentes de bajo peso también aumentó, desde un 3,5 hasta un 7,6%. Se observó un incremento de peso de 4,217 kg al tercer año de uso y un aumento del índice de masa corporal de 1,67 kg/m2 el último año (p= 0,001 y 0,001, respectivamente). Durante el periodo del estudio se realizaron 5 extracciones prematuras del IASE (8%): en 2 casos por deseo de embarazo, en 1 por metrorragia que no respondió a tratamiento, en 1 por aumento de peso y en 1 por exacerbación del acné. No se produjeron embarazos durante el uso del IASE y hubo 15 adolescentes que recambiaron el IASE. Conclusiones: Los efectos secundarios afectaron a un porcentaje bajo de adolescentes y la extracción del IASE por esta causa se dio en 2 casos. Contar con profesionales capacitados en el asesoramiento en salud y un mejor acceso al IASE podría aumentar el uso de este método anticonceptivo, contribuyendo así a disminuir el número de embarazos no deseados.