Aunque ha sido demostrado que la fatiga deportiva puede ser detectada mediante parámetros bioquímicos como la Creatín Kinasa (CK) y la Urea, las últimas tendencias en el estudio del sobreentrenamiento deportivo apuestan por el rol del Sistema Nervioso Autónomo (SNA) como indicador de estados de sobrecarga. El análisis de la Variabilidad de la Frecuencia Cardíaca (VFC), se ha convertido en el método más empleado para determinar la implicación del SNA en estados de sobreentrenamiento, estados de fatiga y asimilación de cargas de trabajo. En un intento de comparar ambas metodologías, el objetivo de esta investigación fue examinar la relación entre parámetros de VFC y perfiles de CK y Urea (P-CK/U). En este estudio participaron 11 remeros del equipo nacional sub 23 masculino español, los cuales fueron sometidos durante 5 días consecutivos en periodo competitivo a un análisis basado en mediciones de P-CK/U y VFC durante la fase de sueño. No se hallaron correlaciones significativas entre P-CK/U y parámetros de VFC; sin embargo los parámetros de VFC correlacionaron entre sí. Aun así, el perfil de CK y los parámetros de VFC mostraron una clara relación cualitativa. La Urea se mantuvo estable durante todo el estudio mientras la CK y los parámetros de VFC oscilaron. Las correlaciones encontradas entre parámetros de VFC apuntan que en futuros estudios no sería necesario utilizarlos todos. La relación cualitativa encontrada entre parámetros de VFC y el perfil de CK sugiere que la actividad parasimpática puede aumentar al mismo tiempo que lo hacen las cargas de trabajo si dichas cargas de trabajo son recuperadas por el deportista