La proteómica es el estudio de los proteomas a través del análisis global de perfiles de expresión proteínica, además de la identificación de proteínas y sus funciones biológicas, en un tejido, órgano u organismo determinado. La oncoproteómica se ha definido como la aplicación de la tecnología proteómica al campo de la oncología, lo cual promete acelerar el descubrimiento de nuevas dianas terapéuticas y biomarcadores útiles para el diagnóstico, el pronóstico y el tratamiento de enfermedades, entre ellas el cáncer. En este sentido, SELDI (surface-enhanced laser desorption-ionization) es una de las técnicas proteómicas que mejor se han adaptado al desarrollo de herramientas con utilidad clínica, como, por ejemplo, el descubrimiento de nuevas moléculas biomarcadoras que sirvan como indicadores de estados fisiológicos normales o de enfermedad. En esta revisión se abordan aspectos generales de las técnicas proteómicas y, en particular, se describen los resultados de algunos estudios que han utilizado SELDI para la generación de patrones proteómicos con la finalidad de identificar grupos de potenciales biomarcadores relacionados con el diagnóstico y el pronóstico de diversos tipos de cáncer.