Fundamento y objetivo: Se presenta una actualización para el período 1994-2002 del mapa bibliométrico de biomedicina en España, tras las publicaciones en Medicina Clínica de los períodos 1986-1989 y 1990-1993. Material y método: Los resultados se circunscriben al subconjunto de documentos citables clasificados temáticamente en 70 disciplinas según el Journal Citation Reports (JCR) de 1996. El análisis bibliométrico se ha basado en indicadores simples (documentos y citas) y compuestos (como colaboración internacional o tanto por ciento de documentos no citados). Resultados: España se sitúa en la decimoprimera posición mundial y en séptima posición dentro de sus homólogos europeos. La producción española supone el 2,4% del total de documentos biomédicos del mundo, aunque solamente el 1,8% de citas recibidas. Cerca de la mitad de todos los documentos van con firma del sector sanitario. El 24,8% de los documentos se firma en colaboración internacional, proporción que acumula el 45,5% de todas las citas. La Comunidad Autónoma de Cataluña destaca por su perfil de investigación clínica; la de Madrid, por su alta densidad de centros del CSIC, y la de Andalucía y la Valenciana, por los documentos procedentes del sector universitario. Conclusiones: Aunque el crecimiento en publicaciones es sostenido, la media de citas recibidas por documento aún no alcanza la media internacional. A pesar de que la internacionalización de las publicaciones ha superado la media mundial, sigue por debajo de la mayoría de países europeos. El análisis de perfiles territoriales y de centros refleja una estructura del sistema científico biomédico español similar a la de los análisis precedentes, aunque con mejores resultados.