Fundamento y objetivo: En 2001 sólo 13 revistas médicas españolas estaban incluidas en el Journal Citation Reports, por lo que se desconoce el factor de impacto (FI) del resto de revistas españolas. El objetivo es determinar el FI de las principales revistas médicas españolas, teniendo en cuenta las citas procedentes de las revistas no incluidas en la cobertura del Science Citation Index. Material y método: Se analizaron las referencias bibliográficas de 1999, 2000 y 2001 de los artículos citables publicados en 2001 en una selección de 87 revistas médicas españolas incluidas en la base de datos nacional Índice Médico Español y en alguna otra base de datos internacional. Se calcularon el número de citas, el FI y el índice de inmediatez de cada revista. Resultados: Se analizaron 5.388 referencias bibliográficas procedentes de 74 revistas fuente o citadoras no incluidas en el Journal Citation Reports y se identificaron las revistas citadas. A estas citas se añadieron las que cada revista había recibido en Science Citation Index. La revista más citada fue Medicina Clínica, con 768 citas, y las de mayor FI fueron Histology and Histopathology (FI = 1,866), International Journal of Developmental Biology (FI = 1,654) y Medicina Clínica (FI = 1,125). Conclusiones: Este trabajo ha permitido obtener el FI de 87 revistas médicas españolas y confirma los resultados obtenidos en trabajos anteriores que mostraron el liderazgo de Medicina Clínica en la medicina española. Las revistas publicadas en inglés han recibido pocas citas del resto de las españolas. La falta de impacto en algunas revistas no está necesariamente relacionada con su falta de calidad, mérito o relevancia.