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Colombia
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Introducción: Klebsiella pneumoniae es un patógeno de prioridad crítica causante de Infecciones Asociadas a la Atención en Salud (IAAS). La bacteria demuestra resistencia a los antimicrobianos (RAM) de forma intrínseca o adquirida. Objetivo: Se analizó la resistencia y la variabilidad genómica de K.pneumoniae en IAAS en el Departamento de Nariño (2021-2023). Metodología: Se identificaron 44 aislados a nivel del gen 16S rRNA, a los cuales se les evaluó la resistencia a 13 antibióticos. La variabilidad genética fue determinada por corte in silico con enzimas de restricción y con los marcadores BOX-A1R-based repetitive extragenic palindromic-PCR (BOX-PCR) y Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR). Posteriormente, se construyó una matriz de presencia ausencia usando los datos de resistencia, datos microbiológicos y origen de infección. Un dendrograma fue construido mediante el coeficiente de similaridad de Dice. Resultados: 44 aislados se identificaron como K.pneumoniae (% identidad>97%, e≈0, cobertura>96%), 95% de estos presentaron multirresistencia, >80% fueron resistentes a fluoroquinolonas, betalactámicos y antibióticos combinados. Se demostró alta variabilidad genómica y mayor frecuencia de aislados procedentes de UCI y de muestras de sangre, se observó coinfección con COVID en el 20% de las muestras. Conclusión: Existe una marcada RAM y variabilidad genómica entre K.pneumoniae. Este estudio corrobora la alarmante problemática que puede enfrentar la salud pública por la RAM y refuerza la necesidad de incentivar la instalación de un buen sistema de vigilancia epidemiológica en la región, para informar las decisiones sobre el tratamiento, orientar las recomendaciones de políticas y evaluar el impacto de las intervenciones de contención de la resistencia.
Introduction: Klebsiella pneumoniae is a critical priority pathogen that causes healthcare-associated infections (HAIs). The bacterium demonstrates intrinsic or acquired antimicrobial resistance (AMR). Objective: The resistance and genomic variability of K.pneumoniae in HAIs in the Department of Nariño (2021-2023) were analyzed. Methodology: 44 isolates were identified at the 16S rRNA gene level, which were evaluated for resistance to 13 antibiotics. Genetic variability was determined by in silico restriction enzyme cutting and with the BOX-A1R-based repetitive extragenic palindromic-PCR (BOX-PCR) and Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) markers. Subsequently, a presence-absence matrix was constructed using resistance data, microbiological data, and origin of infection. A dendrogram was constructed using the dice similarity coefficient. Results: 44 isolates were identified as K.pneumoniae (% identity>97%, e≈0, coverage>96%), 95% of these presented multidrug resistance, >80% were resistant to fluoroquinolones, beta-lactams and combination antibiotics. High genomic variability and a higher frequency of isolates from ICUs and blood samples were demonstrated; coinfection with COVID was observed in 20% of the samples. Conclusion: There is marked AMR and genomic variability among K.pneumoniae. This study corroborates the alarming challenges that public health may face due to AMR and reinforces the need to promote the implementation of a robust epidemiological surveillance system in the region to inform treatment decisions, guide policy recommendations, and assess the impact of resistance containment interventions.
