Los pacientes afectos de secuelas de traumatismo craneoencefálico que permanecen en estado vegetativo merecen especial atención desde el punto de vista terapéutico general y de rehabilitación. El objetivo fundamental es el mismo que el de la fase de coma: la prevención de complicaciones. Los diversos tratamientos farmacológicos y de estimulación sensorial no han demostrado aún plenamente su eficacia.
El tratamiento rehabilitador debe realizarse de forma continuada para evitar problemas secundarios a la inmovilización prolongada y a las lesiones primarias. El tratamiento global del estado vegetativo crónico puede plantear también problemas éticos en cuanto al tipo e intensidad del tratamiento.